時間外労働、深夜労働、休日労働に対する固定残業代を新たに支給しようと思うのですが、固定残業代に見合ったそれぞれの時間数を雇用契約書に記載した方がよいでしょうか。

固定残業代は、当該手当の実質が時間外労働等の対価としての性格を有していること，固定残業代として支払われていることが明確に判定できること（基本給などとの明確区分性）や実際に勤務した時間外労働等に相当する賃金が固定残業代の額を超える場合にはその超過分を支払う実態があること等が求められます。
その上で、固定残業代に見合った時間数を雇用契約書に記載することまで求められるかに関して、現時点では、裁判例がそこまで求めているものとは必ずしも解釈できないものと考えられます。
しかしながら、固定残業代たる性質を争われた場合に備えるためには、時間外、深夜、休日のそれぞれの時間数を書くことが望ましいと考えられます。なぜなら、従業員の労働実態に近い見込み残業を想定して固定残業代を設定したことを考慮要素に加えている判例も存在していることから、固定残業代たる性質を否定されにくくなると考えられているからです。
ただし、それぞれの時間数を書くことで時間外から深夜への融通をきかせて割当てたりすることができなくなりますので（例として時間外5時間、深夜5時間で設定していたが、実際の労働時間が時間外6時間、深夜3時間の場合に深夜の1時間を時間外に充当できるか等）、デメリットも考慮のうえ、自社に必要な固定残業代を見極めることが重要です。